Des événements étranges se produisent au foyer des Hinata... Interrogée par Fuyuki et Natsumi, l'équipe du sergent Keroro ne semble, pour une fois, pas impliquée dans cette affaire. Soudain, le fantôme qui occupait la chambre du sergent se manifeste ! Le spectre est en colère : depuis l'arrivée de la troupe de kerons, plus personne ne le prend au sérieux ! Il enlève alors Natsumi et Keroro... !